Pecore Sotto Copertura segue la storia di George Hardy, un pastore affettuoso che alleva le sue pecore esclusivamente per la lana e passa le serate leggendo loro ad alta voce romanzi gialli, convinto che non capiscano una parola.
In realtà, il suo gregge non solo comprende perfettamente le storie, ma dopo che George va a dormire passa ore a discutere indizi, sospetti e possibili colpevoli, come una vera squadra di detective. Quando George viene trovato morto in circostanze misteriose, le pecore capiscono subito che non si tratta di un semplice incidente: è un omicidio. Convinte di aver imparato tutto ciò che serve dai libri letti dal pastore, decidono di occuparsi personalmente del caso.
Il poliziotto locale, Tim Derry, un agente inesperto che non ha mai affrontato un crimine serio, si rivela incapace di gestire un’indagine così delicata. Così, per la prima volta, il gregge si avventura fuori dal proprio prato, scoprendo che il mondo umano è molto più complicato di quanto le pagine dei gialli lasciassero intendere.
Determinate a rendere giustizia al loro amato pastore, le pecore si trasformano in investigatrici improvvisate, pronte a mettere alla prova il loro ingegno in un’avventura comica e sorprendente.